Safe Green(可替代Sybr Green)是一種新型核酸染料。 Safe Green主要成分是花菁染料,實驗顯示在凝膠染色濃度下沒有發現誘變性,具有使用相對安全、檢測靈敏等特點,可以作為各種核酸電泳的染色劑,適用于各種片段大小染色。與標準凝膠成像系統和可見光激發的凝膠觀察裝置完美兼容,適用于紫外凝膠成像系統或藍色可見光激發的凝膠觀察裝置。
1. 相對安全:盡管可以穿透細胞膜進入細胞內,屬于花菁染料,使用相對安全,實驗顯示在工作濃度(凝膠染色濃度)下無致突變性,可以代替致癌物溴化乙錠EB作為各種核酸電泳的染色劑。
2. 靈敏度高:適用于各種大小片段的電泳染色,對核酸遷移的沒有任何影響。
3.穩定性高:適用于使用微波或其它加熱方法制備瓊脂糖凝膠;室溫下在酸或堿緩沖液中極其穩定,耐光性強。
4.信噪比高:樣品熒光信號強,背景信號低。
5.操作簡單:在預制膠和電泳過程中不降解,可直接用可見光凝膠透射儀觀察。
6.適用范圍廣:可選擇電泳前染色(膠染法)或電泳后染色(泡染法);適用瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳;可用于dsDNA、ssDNA 或RNA 染色。
7.儀器兼容:適用于使用254nm 激發的紫外凝膠成像系統或藍色可見光激發的凝膠觀察裝置。和SYBR Green 的光譜相似。
一、瓊脂糖凝膠電泳染色(推薦方法)
將Safe Green Nucleic Acid Dye加入凝膠中
1.制膠:按常規操作,制備瓊脂糖凝膠,加入濃縮的10,000x Safe Green Nucleic Acid Dye,使其在凝膠中的終濃度為1x(例如:制備50ml的凝膠,加入染料5μl),輕輕搖勻,倒膠。
2.按常規方法電泳,觀測結果(染料不會影響使DNA遷移!)。
二、泡染法
1.按照常規方法進行電泳。
2.用H2O將10,000x Safe Green Nucleic Acid Dye儲液稀釋約3,300倍到純水中,制成3x染色液。
3.將凝膠小心地放入合適的容器中,如聚丙烯容器中。緩慢加入足量的3x染色液浸沒膠。室溫振蕩染色30min左右。
4. 在凝膠成像儀內,觀測結果。
1. 由于Safe Green 具有良好的熱穩定性,可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷卻。搖晃,振蕩或者翻轉以保證染料充分混勻。也可以選擇將Safe Green 儲液加到瓊脂糖粉末和電泳緩沖液中,然后用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。Safe Green 兼容所有常用的電泳緩沖溶液。
2. 如果條帶總是彌散或分離不理想,請使用泡染法染色以確認問題是否與染料有關。如果染色后問題依舊存在,則說明問題與染料無關,請嘗試:降低瓊脂糖濃度;選用更長的凝膠;延長凝膠時間以保證邊緣清晰;改進上樣技巧或選擇泡染法染色。
3. Safe Green對玻璃器皿和非聚丙烯材料具有一定的親合力。建議在稀釋、貯存、染色等使用過程中用聚丙烯類容器。對于聚丙烯酰胺凝膠請使用泡染法。
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答:可能的原因有:
1、膠凝的不均勻或聚合不好,建議灌膠前將溶液充分混勻;
2、某些樣品鹽濃度較高,建議除鹽或將樣品鹽濃度調成一致;
3、緩沖液陳舊,成分改變,可以重配;
4、凝膠下面有氣泡,電泳前要先將氣泡趕走;
5、電泳時溫度過高,可以降低電流或電壓;
6、樣品中含有不溶性顆粒,建議樣品充分攪拌混勻。
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